作者: 小布丁大更新时间:2024-07-26
各种裂解液中的破膜组分主要用于细胞裂解,以便释放细胞内部的蛋白质、核酸和其他生物分子。细胞裂解液的主要目的:1.利用去污剂破坏脂质双分子层,破裂细胞;2. 溶解蛋白;3. 蛋白变性使其稳定;4. 抑制蛋白酶活性
关于去垢剂 (detergents):
几种组织/细胞裂解液裂解强度(应用)的差异主要还是配方中去污剂种类和浓度的不同。去污剂分为变性去污剂(denaturing detergents)和非变性去污剂(non-denaturing detergents),前者可以是阴离子,比如SDS;或阳离子,比如乙基三甲基溴化铵。这些去垢剂总体来说破坏膜和通过打破蛋白-蛋白间相互作用来变性蛋自;非变性去垢剂分为非离子,比如Titon X-100;胆盐,比如胆酸盐类;和两性离子去垢剂,比如CHAPS。
不同类型的裂解液和其破膜组分具有不同的功能和特点:
例如,在免疫沉淀或ELISA实验中,Tween 20常用于洗脱非特异性结合的蛋白质,以减少背景信号,提高实验的特异性和灵敏度。在蛋白质提取和纯化过程中,可以防止蛋白质的非特异性吸附和变性,帮助保持蛋白质的稳定性。CHAPS常用于保持蛋白质活性和结构的同时破裂膜结构,适用于功能分析。Digitonin作为一种温和的去污剂,可以选择性地溶解包含胆固醇的膜,如细胞膜和线粒体外膜,但对线粒体内膜影响较小。这使得它特别适合用于区分和分离线粒体外膜和内膜。常用于选择性地提取线粒体外膜,同时保持内膜的完整性。相比于其他去污剂,Digitonin的作用较为温和,能够在保持蛋白质活性的同时提取膜蛋白,这对于需要保留蛋白质功能的实验非常重要。NP-40是很温和的去垢剂,1%浓度的基本可以破坏掉胞膜,而对核膜破坏的作用弱,结合特定的buffer可以获得胞浆蛋白。
TritonX-100的能力介于NP40和SDS之间,偏向于NP40,溶解脂质,增加细胞膜的通透性,也是常用的细胞裂解液成分之一,在保护蛋白活性方面有一定作用(SDS基本会使蛋白变性失活)。但是去垢剂属性只是一方面,buffer、配比、浓度、提取方法和材料处理也都是关键因素。
2. 阴离子型去污剂(如SDS, Deoxycholate):
• 能有效溶解细胞膜及蛋白质,常用于彻底裂解细胞,提取总蛋白质。
• 会使蛋白质变性,适合用于SDS-PAGE和Western Blot等实验。
例如,去氧胆酸钠能有效地破坏细胞膜和核膜,广泛用于总蛋白质提取。在裂解细胞和组织时,它能够帮助溶解细胞膜中的脂质成分,释放细胞内容物。因此,常用于溶解和提取膜蛋白。相比于非离子型去污剂,它能够更加彻底地溶解难以提取的膜蛋白。
SDS属于阴离子型去垢剂,最厉害,基本可以把细胞完全破掉,DNA会释放出来,裂解液变得很粘稠。
去氧胆酸钠有时与其他去污剂(如SDS)联合使用,以增强去污和蛋白质溶解效果。在某些情况下,与非离子型去污剂(如Triton X-100)联合使用,可以兼顾蛋白质溶解和活性保持。
常见的细胞裂解液成分:
50mM Tris-HCl pH7.4 (缓冲体系)
150mM NaCl (等渗体系)
1mM PMSF (蛋白酶抑制剂)
1mM EDTA (变性剂和稳定剂)
5μg/ml Aprotinin (蛋白酶抑制剂)
5μg/ml Leupeptin (蛋白酶抑制剂)
1% Triton X-100 (弱变性剂)
0.1% SDS (强变性剂和溶解剂)
1% Sodium deoxycholate (中度变性剂和溶解剂)
一些常用裂解液的主要特点和差异:
用于普通的Western、IP或co-IP,通常使用Western及IP细胞裂解液。裂解细胞或组织后,没有非常粘滞的透明状DNA团块形成,不必采用超声处理等就可以非常理想地用于后续操作。另外该裂解液裂解的产物也适合用于磷酸化蛋白的Western检测。
对于某些特殊蛋白的IP,如果发现Western及IP细胞裂解液)效果不是非常理想,可以尝试用RIPA裂解液(强、中或弱)或NP-40裂解液。如果发现IP的时候背景很高,即非特异的蛋白也被IP下来,则需要选用裂解强度较高的裂解液,例如RIPA裂解液(强或中)。如果发现目的蛋白无法被IP下来,则说明裂解液的强度过强,可以使用较为温和的裂解液例如RIPA裂解液(弱)或NP-40裂解液。
对于某些难溶解蛋白的Western,如果发现Western及IP细胞裂解液效果不是非常理想,可以尝试使用裂解强度更高的裂解液例如RIPA裂解液(强、中)或SDS裂解液。
用于特定用途需要自行添加特定抑制剂或不需要添加抑制剂时,可以考虑最后两种。用Western及IP细胞裂解液(无抑制剂)在很多时候可以兼容酶活性和生物小分子的检测,对于特定的酶或生物小分子的检测是否兼容需要自行测试。Western及IP细胞裂解液(无抑制剂)的裂解能力比RIPA裂解液(强,无抑制剂)弱一些,但用于酶活性和生物小分子时,兼容性通常会更好一些。
蛋白酶抑制剂:抑制蛋白酶的活性,避免蛋白过度降解。
3. 裂解酶(如Lysozyme, Trypsin):
• 针对特定类型的细胞,如细菌细胞,能够降解细胞壁成分,使细胞膜易于裂解。
• 常与其他裂解剂联合使用,增强裂解效果。
4. 机械破碎法(如超声波裂解、玻璃珠研磨):
• 不依赖化学裂解液,适用于坚硬的细胞壁(如酵母和植物细胞)。
• 可通过控制处理强度和时间调节裂解效果。
5. 高渗或低渗裂解(如低盐缓冲液):
• 利用渗透压差导致细胞胀裂或收缩破裂,适合裂解脆弱的细胞类型。
• 通常配合其他裂解方法使用,以提高效率。
6. 有机溶剂(如乙醇、乙酸乙酯):
• 能溶解脂质膜,但可能对蛋白质有较大破坏作用。
• 适用于某些特定实验,如脂质分析。
选择合适的裂解液及其破膜组分,取决于具体的实验目的和细胞类型。确保实验条件不会破坏目标分子的活性或结构,是进行成功实验的关键。
(来源 微信公众号:“科研这点事儿”)